冥王星へ向かうイブニングポスト誌の二人の記者ゲイリーとハーブは漂流中の宇宙船を発見。老朽し切っているばかりか、推進装置さえ見当たらぬこの不思議な船には生存者が居た。１０００年の孤独な支弁の後に、驚異的な知力を獲得した少女が。
一方冥王星では、大宇宙の深淵より発せられた人知を超越する怪信号の解析にキングスリ博士が取り組んでいた。そして、このふたつがひとつに結び合わされた時、終焉するべく定められた大宇宙の運命と、それを阻止する人々のドラマが幕を開ける。