大きな古い家に引っ越してきた女の子、コラライン。
ある日、どこにも通じていないはずのドアを開くと、そこには気味が悪いほど真っ白な肌をした女の人が立っていた。
「だれにでもみんな、もうひとりのママがいるのよ、コラライン」
もうひとりのママ？そんな！部屋にもどると、本物の両親はあとかたもなく消えていた。　たよりになるのは名なしの黒ネコと、穴のあいた不思議な石だけ。
コララインは今、さらわれた両親をたすけだすために、たったひとりでもう一度、あのドアを開くー。