「憎い…わしは貴様が憎い!」闇の中から呪詛の声がひびく。同時にリンクとゼルダの足元から地面が消えた。「リンクよ、ワシの時代へ来るがいい。必ずや、おまえを倒してくれる…」白い空間を落ちていくリンクの耳に滅びたはずの、ガノンの声が響く。恨みを抱いて死んだヤツの怨念が、ふたりを過去へと引き寄せたのだ。目の前に浮かぶゼルダの姿が、消えた!そして…。初代王の御世に跳んだリンクを、意外な敵が待ち受ける。再び勝利を手にする日はいつか!?