化けダヌキの子供、エンヤが父と一緒に変化の術を練習している時、人間の子供に化けていた所に伊賀忍者のくの一に村の子供たちと一緒に拉致されてしまう所から話が始まります。
タヌキであることが発覚したら食べられてしまうという状況の中、エンヤは忍者の修行をする羽目になります。保護者である３人のくの一や仲間であるKODOMO忍者の面々、伊賀忍者百地三太夫のドラ息子の百地百太郎や化けギツネの子供ジローなどといった一癖も二癖もある面々との日常を描いた作品です。